蜂蜜の前処理における高速遠心分離機の主な役割は、ターゲットの濃縮です。約12,000 x gの遠心力を発生させることにより、希釈された蜂蜜溶液から病原体細胞、胞子、その他の不溶性成分を効果的に沈殿させます。この機械的分離により、液体マトリックスから生物学的ターゲットが分離され、下流分析に適した濃縮ペレットが作成されます。
コアインサイト:蜂蜜は複雑で大量のマトリックスであり、病原体はしばしば微量しか存在しません。高速遠心分離機は、サンプル量と検出限界の間のギャップを埋めます。大量のサンプルの生物学的内容物を高密度のペレットに圧縮し、DNA濃度を直接高め、診断テストの感度を最大化します。
病原体濃縮のメカニズム
蜂蜜マトリックスの克服
蜂蜜は粘性が高く、化学的に複雑です。分析を開始する前に、通常、粘度を下げるためにサンプルは希釈されます。
希釈された状態でも、細菌や胞子は懸濁したままです。高速遠心分離機は、この懸濁状態を克服するために大きな力を加え、固体の生物学的物質をチューブの底に押し付けます。
12,000 x gの必要性
標準的なろ過や低速回転では、微生物ターゲットには不十分な場合があります。
(腐蛆病の原因となるような)小さな細菌細胞や丈夫な胞子を効果的に沈降させるには、約12,000 x gの力が必要です。この特定の閾値により、軽量の生物学的粒子でさえ沈殿物に捕捉されることが保証されます。
診断パフォーマンスへの影響
DNA収量の増加
この前処理の最終的な目標は、PCRまたはシーケンシングのためのDNA抽出であることがよくあります。
上清(液体の上層)を捨て、ペレットを保持することにより、抽出に利用できるターゲット遺伝子コピーの数を効果的に増やします。このステップにより、低濃度のサンプルが高濃度の入力に変換されます。
感度の向上
診断機器には検出限界(LOD)があります。
病原体が非常に低いレベルで存在する場合、蜂蜜の直接検査では偽陰性となる可能性があります。遠心濃縮により、サンプルがLODを超え、微量の汚染が正確に検出されることが保証されます。
アプリケーションとトレードオフの区別
分析用遠心分離機と工業用遠心分離機
実験室での前処理と工業的処理を混同しないことが重要です。
工業用遠心分離機は、物理的構造を維持し、ワックスのような粗い破片を除去するために低速を使用して、巣脾から蜂蜜を採取するために使用されます。対照的に、ここで議論されている高速遠心分離機は、バルク食品加工ではなく、微生物学的分離専用の実験室グレードの機器です。
遠心分離の限界
遠心分離は固体を濃縮しますが、液体に溶解した化学的汚染物質を除去するわけではありません。
たとえば、殺菌剤や可溶性抗生物質を検査している場合、遠心分離だけでは不十分です。これらのワークフローでは、通常、沈降ではなく、高速ボルテックスと溶媒抽出(乳化)が必要です。
目標に合わせた適切な選択
蜂蜜分析プロトコルを確立する際は、機器が特定のターゲット分析物に適合していることを確認してください。
- 病原体検出(細菌/胞子)が主な焦点の場合: DNA抽出のための生物学的細胞の沈降を最大化するために、少なくとも12,000 x gを可能にする遠心分離機を優先してください。
- 物理的純度(採取)が主な焦点の場合: 巣脾構造を破壊することなく蜂蜜を分離するために、低速の工業用遠心分離機を使用してください。
- 化学残留物(農薬)が主な焦点の場合: 固液分離ではなく液液抽出を促進する高せん断ボルテックスミキサーに焦点を移してください。
病原体検出の成功は、テスト自体だけでなく、テストが開始される前のサンプルの機械的濃縮にも依存します。
概要表:
| 特徴 | 実験室での前処理 | 工業的処理 |
|---|---|---|
| 主な目的 | 病原体/微生物の分離 | 蜂蜜の抽出/破片の除去 |
| 必要な力 | 高速(約12,000 x g) | 低速から中速 |
| サンプル状態 | 希釈された液体マトリックス | バルク生蜂蜜/巣脾 |
| 出力 | 濃縮された生物学的ペレット | 清澄化された液体蜂蜜 |
| 主な結果 | PCRのためのDNA収量の増加 | 物理的純度の向上 |
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参考文献
- Mariko Okamoto, Daisuke Takamatsu. A novel multiplex PCR assay to detect and distinguish between different types of <i>Paenibacillus larvae</i> and <i>Melissococcus plutonius</i>, and a survey of foulbrood pathogen contamination in Japanese honey. DOI: 10.1292/jvms.21-0629
この記事は、以下の技術情報にも基づいています HonestBee ナレッジベース .
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